【阿里云】基因计算分析解决方案

基因测序技术日新月异，围绕着基因组学的基础科学研究和临床医学应用，也正在取得突破性的进展。阿里云为海量基因组学数据的计算分析提供高效安全的完整解决方案，帮助生物科技公司、科研人员和医疗健康机构构建广泛可靠、敏捷智能的基础平台和业务系统。

业务场景

基因计算分析
安全可靠的基础设施，随时随地开启计算分析之旅

架构特点
强大云基础设施支撑，支持多种接入方式，提供完备的计算分析工具套件
数据存储和传输全程加密，安全可靠，合法合规
丰富的生信应用生态，助您快速开启云上计算分析之旅

工作流管理
支持社区流程标准，实现云端高效并行的分析

架构特点

统一标准，简化开发测试过程，帮助用户轻松实现云上高效的分析流程
用户只需关注流程开发本身，计算实现由阿里云自动进行调度优化，包括任务并行，错误重试、中断可恢复、性能统计，效率优化等
方便流程管理和维护，实现版本化，可重复、可审计的分析过程

弹性高性能计算集群
无缝迁移线下分析应用，实现基因计算弹性扩展。

架构特点
一键部署 HPC 集群，包括 SGE/SLURM 等常用调度器。图形化管理用户、任务队列，维护集群节点
与本地 HPC 集群环境完全一致，应用程序无需任何改造，可以直接在阿里云环境运行
不需要固定集群，提供任务队列级别的计算节点扩缩容，从0到上千台几台。结合按需、竞价实例、预留实例券等付费方案，提供远超传统 HPC 集群的灵活性
使用 NAS、CPFS 等高吞吐文件系统，提供作业级别的任务监控，最大化调整和保障分析性能

容器混合云
资源、服务、数据应用统一管理，线上线下跨地域融合

架构特点
阿里云 ACK 服务提供弹性计算能力和资源调度优化，提供工作流支持，可以完成大批量基因数据分析工作
阿里云容器混合云架构，能够统一流程、统一资源、统一管理、实现云上云下一体，支撑企业跨地域多集群管理
本地 IDC 集群提供无服务化的集群扩容，可以在公有云快速创建资源，加入到线下的集群中，解决业务高峰的问题

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三代组装全面加速
Canu 软件同时适用于 PacBio SMRT 与纳米孔测序两款主流的单分子测序平台的数据，可以执行 reads 的纠错与组装部分的工作。阿里云优化三代组装软件 Canu，在保证基因组的组装质量完全一样的情况，运行时间和成本降低50%以上。完美解决超大基因组组装耗时长，计算量大的难题。

方案优势
立刻开始任意规模的基因计算分析
无需购买和维护基础设施，立刻获得充足的计算资源。阿里云可以按照用户业务情况，进行弹性伸缩，用户仅为实际使用的资源付费。结合包月、竞价等多种付费方式，可以经济高效的处理海量分析任务。

利用阿里云进行业务创新
从使用 FPGA 来加速全基因组计算、到使用深度学习模型进行肿瘤早筛，阿里云以完全托管云服务的方式，为用户提供最新的硬件、工具和算法模型等，帮助领域专家们在不同场景实现业务创新。

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